NimbleDesign罗氏序列捕获定制设计软件上线

2013-07-17 21:29 · 罗氏诊断产品（上海）有限公司

NimbleDesign是罗氏罗氏NimbleGen推出的免费在线软件，用于NimbleGen SeqCap EZ Choice以及Choice XL人类基因组目标区域的序列定向捕获探针设计。

NimbleDesign是捕获罗氏NimbleGen推出的免费在线软件，用于NimbleGen SeqCap EZ Choice以及Choice XL人类基因组目标区域的定制定向捕获探针设计。现在您只需用一分钟注册您的设计上线账户，就可以享受到NimbleGen专有的软件探针算法所带来的高密度、高覆盖、罗氏高效率的序列探针设计，从而开始您感兴趣的捕获目标区域定向富集，以及后续更多的定制二代测序应用。

NimbleGen SeqCap EZLibrary系列序列捕获产品的设计上线探针设计拥有其独特的优势，以每次捕获设计拥有多达200万个探针、软件探针采用在目标区域的罗氏高密度叠式排布而著称，保证了在捕获过程中对于包括片段插入缺失等各种类型突变的序列有效捕获。这些特点不仅来自于来自于探针设计时所采用的捕获算法。NimbleGen建立了特殊的探针设计算法，使得NimbleGen的高密度探针生产工艺可以更好地应用到序列捕获之中。而且NimbleGen优化了repeat mask算法，使得目标区域中的更多碱基序列可以直接设计探针，从而保证了目标区域的更高覆盖。

NimbleGen自有算法可以更好的针对目标区域进行探针设计。例如上图中对11号染色体上一个500kb的区域进行探针设计，黑色区域分别表示由两种不同算法计算出的探针所能覆盖的区域，而红色区域表示只有NimbleGen的设计能覆盖的区域。

而NimbleDesign将NimbleGen探针算法带到您的身边，是NimbleGen Bioinformatics团队心血之作，从此您可以全天候、全时段、零距离地使用NimbleGen专有的探针算法。